Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms