Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW822073A0A0N4SUK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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AW822073A0A0N4SUK1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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AW822073A0A0N4SUK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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AW822073A0A0N4SUK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AW822073A0A0N4SUK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AW822073A0A0N4SUK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms