Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv16A0A0B4J1H3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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