Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Gm28919A0A087WP35 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Gm28919A0A087WP35 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Gm28919A0A087WP35 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Gm28919A0A087WP35 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Gm28919A0A087WP35 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm28919A0A087WP35 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm28919A0A087WP35 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm28919A0A087WP35 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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