Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrit3W8DXL4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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