Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms