Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vstm4T1NXB5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm4T1NXB5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms