Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm26992S4R1A3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm26992S4R1A3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms