Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top3bQ9Z321 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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