Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac5Q9Z2V6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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