Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd1Q9Z2E2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd1Q9Z2E2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms