Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd3Q9Z2D8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms