Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs4Q9Z1T2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs4Q9Z1T2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms