Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr5Q9Z1P4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms