Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nek4Q9Z1J2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek4Q9Z1J2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms