Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Znf394Q9Z1D9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Znf394Q9Z1D9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf394Q9Z1D9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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Znf394Q9Z1D9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf394Q9Z1D9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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