Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Padi1Q9Z185 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Padi1Q9Z185 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms