Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20bQ9Z104 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20bQ9Z104 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms