Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard6aQ9Z101 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard6aQ9Z101 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms