Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NgfrQ9Z0W1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgfrQ9Z0W1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms