Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb6Q9Z0T9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms