Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
S1pr4Q9Z0L1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
S1pr4Q9Z0L1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.4 ms