Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms