Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katna1Q9WV86 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katna1Q9WV86 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms