Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1a4Q9WV27 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a4Q9WV27 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms