Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stub1Q9WUD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms