Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus1Q9WU56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms