Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scnn1bQ9WU38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scnn1bQ9WU38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms