Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6cQ9WTM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema6cQ9WTM3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms