Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab25Q9WTL2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab25Q9WTL2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms