Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PplQ9R269 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PplQ9R269 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PplQ9R269 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms