Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TapbpQ9R233 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TapbpQ9R233 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms