Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc6Q9R1S7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms