Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mpdu1Q9R0Q9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms