Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M6

Rab9a, Ras-related protein Rab-9A, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab9aQ9R0M6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab9aQ9R0M6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab9aQ9R0M6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms