Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fhl3Q9R059 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fhl3Q9R059 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms