Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11aQ9QYE3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms