Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jag1Q9QXX0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jag1Q9QXX0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms