Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip3Q9QXT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms