Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip4Q9QXN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms