Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms