Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptf1aQ9QX98 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptf1aQ9QX98 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms