Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyth1Q9QX11 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyth1Q9QX11 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms