Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Homer2Q9QWW1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Homer2Q9QWW1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms