Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdcQ9QW08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdcQ9QW08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdcQ9QW08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms