Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms