Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sfmbt1Q9JMD1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfmbt1Q9JMD1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms