Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms