Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA2

Qtrt1, Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qtrt1Q9JMA2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Qtrt1Q9JMA2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Qtrt1Q9JMA2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms