Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LitafQ9JLJ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LitafQ9JLJ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms